自己レスですが11000系はまだ営業運転に入ってないそうですね。どこが悪いんでしょうね？搬入後これだけ走らないのも珍しいのではないでしょうか。
３３１系なみですか？

新車だけに誘導障害なんかで遅れているのかも．公式試運転は無事に終わったのでしょうか

どうやら車両限界が拡大されたのが、ここまで遅れている要因のようです。

図面上もベース車との関係も車両限界は10000系と変わらぬ筈。
二次車での設計変更内容から誘導障害の影響が明確になるのでは

鉄道ホビダスの「編集長敬白」に、車両限界が拡大されている旨が書かれていますよ。